Les champignons de l'ambre

Les champignons de l'ambre

      La plupart des champignons (petits champignons sur pieds et autres moisissures, tel que nous l'entendons) sont des organismes qui, imprégnés d'eau, sont altérables au moindre choc... Amorphes, fragiles, éphémères et mous, ne vivant d'ailleurs que quelques jours complètement développés, les petits champignons sont sensibles au chimisme de la résine et sont, de fait, de très mauvais acteurs de la scène d'ambre. Et, pourtant ils devaient être nombreux et bien distribués dans le paléo biotope de la forêt humide...
Les rares découvertes de champignons émerveillent les mycologues ! Sans ambre, pas le moindre indice exploitable sur la présence éventuelle des champignons antiques. Exception faite de quelques traces dans les grès (à Álava) dans le nord de l'Espagne, il n'y a que l'ambre pour restituer les premiers champignons. Mais, découvrir un champignon de l'ambre, cela se mérite...

      C'est en travaillant précisément les paramètres (d'un nouveau procédé d'exploration) de la prise d'image des inclusions organiques de l'ambre que l'on peut révéler les détails de quelques champignons diaphanes, lesquels, sont pourtant de précieux bio indicateurs du palé biotope. Cependant l'incertitude de la datation des échantillons, les données fragmentaires sur le support, le mauvais examen des séries -où les fossiles font surtout défaut- rend difficiles les descriptions phylogénétiques ainsi que les aires cosmopolites des aires de paléo distribution. Mais, peu importe la difficulté. Révéler de si précieuses inclusions est un voyage de contemplation qui rivalise de beauté avec l'histoire merveilleuse de raconter les populations entomologiques de la forêt d'ambre.

      Tandis que le web devient payant, tandis qu'il faut payer avec sa carte bancaire pour consulter un article (où n'apparaissent pas les images!), offrons nous GRATUITEMENT sur Ambre.Jaune un "Voyage pédagogique" au pays des champignons de la forêt d'ambre !

En forme d'entonnoir, assise ronde soutenant un réceptacle lisse, l'inclusion
balte, ... n'est pas une fleur... Ce n'est pas non plus, ... un insecte.
Bref, c'est quoi ?

Découverte, Collection et Photographie : Eric GEIRNAERT, (juin 2000).

Classification évidemment perfectible, rangés ici dans le site web Ambre.jaune, dans le registre des inclusions associées à l'eau, les champignons de l'ambre apparaissent surtout dans les biotopes forestiers, (mais proches d'un delta ou sur l'estran de la presqu'île d'un site) où apparaissent, étrangement, ... de TRES nombreuses traces d'eau...

D'un point de vue numérique, en nombre d'inclusions trouvées par lot de brut examiné, les mycètes de l'ambre semblent effectivement associées aux inclusions d'un micro biotope aquatiques ou semi aquatique où existent quelques protozoaires, des micro algues, quelques flagellés et des protozoaires parmi une entomofaune bien distribuée et surtout inféodée au biotope d'eau, au moins pour les larves...
Dit autrement : 'dans ce lot où apparaissent quelques insectes qui venaient pondre, les traces de champignons sont très nombreuses'...

En forme de coupe régulière ouverte et qui ressemble alors à une corne d'abondance
(ou une trompette), ce magnifique champignon balte, 10 mm, partiellement
digéré par la résine, est une mention unique d'une espèce jamais référencée.

Découverte, Collection et Photographie : Eric GEIRNAERT, (juin 2000).

Découverte, Collection et Photographie : Eric GEIRNAERT, (septembre 2010).

La présence des champignons dans l'ambre jaune est attestée par de très rares fossiles, (comme ci-dessus), qui correctement "analysés", pourraient laisser penser que certaines espèces étaient colorées...

Voici le détail d'une inclusion minuscule et fragile...

Découverte, Collection et Photographie : Eric GEIRNAERT, (septembre 2010).

Le petit champignon aura-t-il été arraché de son support à la suite d'une
tempête, qui, temporairement aura bouleversé les données du
biotope, -où d'ailleurs l'assemblage de traces de plusieurs
bois fossiles devrait permettre de comprendre
d'avantage la situation précise du site-.

Petits "ballons" montés sur des pieds droits, certains champignons comme les Aspergillus sont de véritables raretés de l'ambre. Ces champignons filamenteux (imparfaits) sont rattachés à la classe des champignons Deutéromycètes.

Les petites moisissures saprophytes, sur pied, (ici minuscules, et, associées à un biotope humide), sans doute présentes partout dans la forêt d'ambre, sont rares, très rares en inclusions... Ces champignons impliqués dans de nombreuses pathologies ne sont pas corrélés à un affaiblissement (théorique) des arbres antiques dont la réponse physiologique aurait été matérialisée par une sécrétion excessive de résine (désignée sous le nom de succinose).

De la classe des Ascomycètes, de l'ordre des Eurotiales, les Aspergillus sont des champignons filamenteux, de type moisissure, (difficiles à repérer dans l'ambre) dont la colonie se présente, comme ici, sous forme duveteuse...

En examinant -en détail- les inclusions fossiles, on peut supposer que quelques spécimens antiques (à croissance rapide car plusieurs morphes synchrones apparaissent dans quelques échantillons d'un même lot) pouvaient probablement être colorés. Exception faite de cette mention unique d'une moisissure restée colorée, (photo ci-dessous), les couleurs vives -et sans doute variées- des spécimens antiques retrouvés dans l'ambre (surtout au niveau des conidies, = spores assurant la multiplication asexuée des champignons) ont été dénaturées par le chimisme de la résine. On connaît environ 200 espèces d'Aspergillus actuels. Le thalle cloisonné, (formé de nombreuses conidies, formant la "tête aspergillaire") est porté droit sur un petit pied particulièrement fragile aux attaques de la résine. Les Aspergillus sont ubiquistes, cosmopolites... Et, constituent surtout des inclusions précieuses pour le collectionneur, (=humour).

Ces moisissures (rarement colorées), ici repérée sur l'antenne d'une petite abeille sans aiguillon, se développent souvent sur la matière organique morte et semble croître dans le milieu piège de la résine fraîche. Les filaments, très fins, grandissent et traversent tant les structures organiques du support que les coulées de la résine. La coloration de cette mention n'est rigoureusement pas un artefact...

Voici une autre inclusion de l'ambre pouvant facilement passer inaperçue...

Autre inclusion pouvant facilement passer inaperçue, voici des moisissures (Beauveria ?) sur une dépouille animale du plus grand intérêt !

      De nombreuses petites moisissures et champignons devaient exister dans la forêt d'ambre (dont on notera que le climat devait être chaud et humide). Cependant, les références mycologiques retrouvées dans l'ambre sont rares.
Cette magnifique larve de coléoptère (nimbée dans un son halo blanc de dégazage, signature avérée d'un matériel balte qui réagit à l'humidité) est recouverte d'une moisissure blanche particulièrement fine et surtout difficile à examiner.
L'avantage de photographier les inclusions organiques à partir du matériel brut conservé en volume 3D est de pouvoir aller chercher les angles intéressants des meilleures prises de vue, (3 sont présentées ici) ce que ne permet pas le montage des inclusions en lames minces.

      Il est intéressant de supposer (c'est une hypothèse) la rapide colonisation de la moisissure sur le substrat mort. On notera qu'à l'arrière de l'abdomen, la larve de coléoptère est piégée avec de nombreuses portions de bois et particulièrement des feuilles et des tiges (d'espèces aquatiques?). La petite moisissure devait peut-être déjà exister du vivant de l'insecte, se développant alors, sans doute, sur des feuilles endommagées qui devenaient nécrotiques. Cachée dan le halo blanc, ces petites formations filamenteuses blanches ressemblent assez à des à des champignons Beauveria, champignons imparfaits filamenteux appartenant à la classe des Deutéromycètes. Le Beauveria regroupe quatre espèces saprophytes ou parasites et entomopathogènes. Les colonies sont cotonneuses à poudreuses, généralement de couleur blanche ou jaune pâle à rose pâle.

      Cette larve d'insecte, (sans doute un coléoptère), couverte de champignons, certes, pas très "esthétique" (pour une collection) est cependant extraite du cd-Rom Ambre qui regroupe un large panel des belles et rares inclusions. C'est surtout la technique photographique, qui offre la possibilité d'aller chercher les indices infimes cachés dans la résine. Présenton deux autre cas, où l'image va chercher le thorax d'un diptère, puis, le dos d'un psoque...

Découverte, Collection et Photographie : Eric GEIRNAERT, (septembre 2010).

Découverte, Collection et Photographie : Eric GEIRNAERT, (septembre 2010).

Après les mosissures fines, -difficiles à examiner-, observons maintenant des petits amas globuleux et ramifiés, (plus sombres) piégés dans l'ambre, qui ressemblent à des lichens.

Inclusions globuleuses, ramifiées, souvent associées à des insectes mais
qui restent difficiles à déterminer avec précision...

De la classe des Ascomycètes, ces formations ovoïdes, parfois globuleuses, en colonies duveteuses, qui apparaissent de couleur grise à vert olive, pourraient être des Chaetomium ? On notera des poils simples ou ramifiés, raides, (ondulés ou parfois spiralés) qui résistent assez bien à la force du flux de la déformation par l'écoulement de la résine. Sans doute ubiquitaires et assez communes dans l'environnement de la forêt de résine, ces formations globuleuses ramifiées sont souvent associées à des insectes, et, peut-être phytopathogènes, pouvaient-elles être impliquées dans diverses infections.

Tandis que l'Université de Cornel nous explique le potentiel formidable que constitue la découverte d'un champignon Aspergillus sur un collembole de l'ambre, (fossile entreposé au musée Smithsonian), présentons un collembole de l'ambre (ci dessous) parasité par des champignons fossiles d'espèces non documentées ?! Il est probable que ces champignons antiques, (peut-être saprophytes ?), puissent avoir été parasites d'insectes vivants... Au regard du potentiel formidable de ces fossiles rares, qui émerveillent les spécialistes, présentons quelques spécimens issus de ces lots d'ambres bruts où les traces d'eau et d'humidité du paléo biotope sont nombreuses.

Découverte, Collection et Photographie : Eric GEIRNAERT, (septembre 2010).

Le champignon, c'est le label de prestige de la belle collection !

A ce jour, tous gisements confondus, (Eric G. 2002), la plus vieille inclusion identifiée est celle d'un champignon dans un ambre anglais du Carbonifère (Smith 1896). Cet ambre, connu sous le nom de Middletonite, a été trouvé dans le district de Kilmarnock. En plus du pollen et de différentes portions incomplètes de fleurs de conifères, l'échantillon contenait un fossile de champignon du plus grand intérêt (dans une nouvelle espèce et dans un nouveau genre, et, même dans un ordre inédit). La seconde inclusion, toujours en terme d'ancienneté, est encore un champignon trouvé dans un ambre triasique allemand (Carnien 125 M.A.).

Quelques mycètes fossiles peuvent être référencés dans l'ambre, car plusieurs
espèces se développent à l'extérieur des insectes, enveloppant les organes.
Découverte, Collection et Photographie : Eric GEIRNAERT, (septembre 2010).

Mais, certaines espèces se développent à l'intérieur des insectes et traversent
la cuticule comme cela apparaît sur les yeux à facette de ce diptère.
Découverte, Collection et Photographie : Eric GEIRNAERT, (septembre 2010).

Le champignon se développe à l'intérieur de la pupe de cet insecte et
traverse la cuticule pour croître, quelques temps, dans la résine fraîche.
Découverte, Collection et Photographie : Eric GEIRNAERT, (octobre 2010).

Cette dernière découverte est surtout intéressante car elle montre (démontre?, ou plutôt semble indiquer) que les filaments se sont développés dans la résine fraîche (encore tendre, = non indurée) en franchissant sans déformation les coulées de résine déjà déployées sous le poids de la pesanteur. Là où l'insecte meurt par étouffement, le champignon semble pouvoir se développer quelques temps dans le milieu piège de la résine en progressant libre dans la gemme ?... Ces observations difficiles dans la résine ont été rendues possibles par l'invention d'une nouvelle méthode d'observation non destructives des échantillons, -méthode bientôt présentée en article dans la presse avec une version cd-rom de la photothèque AMBRE-.

Voici un champignon qui semble s'être déployé "librement" -sur une patte de moustique-
sans déformation du fluage par la contrainte des forces exercées par le
poids du flux de la résine qui roule en coulées successives...

En examinant les petites inclusions de l'ambre, il semble que l'on puisse
avoir la preuve de la colonisation de la gemme tendre
-avant induration- par des espèces vivantes !

Revenons à cette hypothèse où le champignon filamenteux pourrait se développer quelques temps, dans le milieu piège de la résine encore fraîche. La lecture taphonomique du fossile démontre le fait.

Une lecture taphonomique du fossile démontre que le champignon A1 (au premier plan) s'est déployé dans le milieu stabilisé (immobilisé) alors que celui avait précédemment étiré le champignon A2 dans la direction des forces qui d'ailleurs ont modifié la position des insectes comme l'indique l'aile ouverte du diptère B, en arrière plan. Collé au tronc de l'arbre -déjà dans la résine?-, le champignon A2 a été déformé par le mouvement du flux de la résine sous le poids de la pesanteur. Puis, la résine tombée au sol -donc figée- a laissé vierge le déploiement libre du champignon A1... La lecture taphonomique de la gemme donne la chronologie logique du fossile et démontre effectivement qu'un champignon progresse dans le milieu piège resté tendre.

La taphonomie d'un champignon !

Comment interpréter le fossile ci dessous : un petit panache étrange attenant à un insecte est déformé par le fluage tandis
qu'un second, attaché au même insecte, est rayonnant... La découverte d'une inclusion mycélienne dont la
croissance est rayonnante (sur une dépouille animale déjà roulée par le fluage) constitue
une preuve irréfutable d'un développement retardé.

Le petit fossile avec moisissures double orientations dans un même fluage, une rareté !
Les champignons A1 et A2 sont sur les pattes d'un même moustique et, pourtant, ils ne sont pas affectés par
les mêmes déformations plastiques... Le champignon A1 s'est développé (après A2) sans
doute lorsque la résine fraîche, tombée au sol, était figée...

      Le développement d'organismes vivants dans l'ambre serait un conte de fée ?!

      Selon certains internautes qui se mêle de commenter et critiquer sans cartouche, le développement d'organismes vivants dans l'ambre serait un conte de fée ! Un confrère me disait récemment : Ce qui me sidère c'est que ceux qui n'ont rien à présenter, n'ont rien écrit ou photographié se mêlent de commenter et critiquer sans cartouches. C'est comme souvent "les cons osent tout, c'est même à ça qu'on les reconnaît" (Lino Ventura).
Le développement d'organismes vivants dans l'ambre (avant fossilisation), n'est pas un conte de fée !

      Et, pour éclairer le sujet, commentons cette photographie, présentée, ci-dessus.

      Dans un même fossile d'ambre, sur un moustique somme toute assez commun, plusieurs amas de moisissures présentes aux pattes suivent le flux d'ondes de la résine, laquelle, coule sous l'effet de la pesanteur en étirant les filaments vers le bas et la gauche de l'image comme cela est visible en A2.

      Mais, chose REMARQUABLE, sur le dit moustique (qui apparaît flou sur le bas à gauche de l'image, -excusez le cliché, l'image souhaite surtout montrer les moisissures-) la patte médiane au point A1 montre une moisissure qui semble s'être développée de façon radiale, -dans toutes les directions- en ignorant les forces de la résine !!! C'est comme si ce développement de moisissure ignorait le fluage surtout efficient au point A2. Alors pourquoi un tel paradoxe? Le développement radial d'une moisissure qui gagne le milieu piège dans un axe de croissance non-conforme au fluage (d'ailleurs enregistré par les mêmes moisissure sur le même insecte) suggère une chronologie des évènements où l'organisme vivant qu'est la moisissure semble avoir colonisé la résine encore plastique mais immobilisée sans doute dans les roches encaissante du dépôt. Ce fossile qui existe en tant que tel, où deux directions apparaissent pour la progression des moisissures, est une preuve que des organismes vivants peuvent coloniser la résine pendant le fluage et quelque temps après.

      Preuve est donnée par cette référence intéressante que des organismes vivants peuvent se développer vivants dans la gemme (avant induration). Oui, des moisissures peuvent croître dans la résine tendre, qui, bientôt durcie par la diagenèse bloque tout développement de croissance. Certains ambres colorés (anormalement) semblent avoir été imprégnés par des pigments d'organismes colonisateurs (algues bleus, pigments de champignons). Le panache d'une moisissure qui traverse les flux d'ondes de la résine ignorant le fluage antérieur fait penser un peu aux racines d'un arbre qui transpercent les couches sédimentaires profondes éventuellement déformées du sol. Le panache de moisissure A1 s'est développé après l'effet fluage (déformation lente par la contrainte du mouvement fluide) et a profité des liquides viscéraux de l'insecte. Le développement d'un organisme vivant dans le milieu piège est donc démontré par une lecture taphonomique sur un fossile. Nous ne sommes pas ici au niveau de l'hypothèse mais des faits. Raconter le fossile dans une lecture taphonomique n'est pas une hypothèse, c'est un exercice de pure logique. La résine antique que l'on pensait une matière piège étouffante, (actualisme oblige) a laissé croître des organismes vivants dont la progression est occasionnellement significative dans une lecture taphonomique! Ce fossile très utile à la démonstration atteste que des organismes vivants peuvent coloniser une gemme encore tendre à l'origine de l'ambre. Ce fossile bouleverse nos idées dogmatiques du milieu piège de l'ambre.

      Je suis surpris que l'on n'apporte pas plus d'intérêt aux lectures logiques des indices taphonomiques des inclusions organiques. Les travaux publiés se limitent trop souvent aux descriptions morphologiques des types nouveaux. Mais, des choses simples comme les positions des objets sont souvent ignorées. Et, il faut une redoutable précision optique pour aller chercher les moisissures diaphanes dans des ambres conservés en volume 3D. Si vous débitez les ambres en lames minces, vous risquez de passer à coté de belles découvertes. Certaines algues aquatiques, des moisissures aériennes semblent avoir été capables de coloniser les résines antiques. Cette découverte complète le travail de lecture de certains auteurs qui admettent enfin des "perméabilités biotiques" (certes limitées dans le temps) à des organismes dénués de force physique mais qui apparaissaient parfois profonds dans la gemme ! Attention, croissance, ne veut pas dire présence ! Trouver une inclusion organique couverte de moisissures ne permet pas forcément de démontrer la croissance post-mortem ! Une seule référence parmi une centaine d'observations permet dans ma collection de développer la démonstration taphonomique.

Pour ceux qui souhaiteraient suivre l'étude des champignons de l'ambre rappelons (Eric G. 2002) que l'apparition des premiers conifères fournit des débris sporadiques de résines d'âge carbonifère... Et, ces premières sécrétions fossiles ont permis de découvrir en Angleterre, la toute première inclusion du Paléozoïque, il s'agit d'un champignon (Smith, 1896).

Comment mieux finir cette présentation (non exhaustive) des champignons de l'ambre qu'en présentant UNE MENTION UNIQUE? Cette image montre le développement de champignons mycètes de l'ambre qui participent à la putréfaction d'une portion de cadavre. Le champignon se développe sur une section d'un doigt de lézard et accompagne le mouvement du flux de la résine avant fossilisation en ambre. Avec la découverte de sang fossile coulant d'une dépouille (=dépouille sanguinolente, voir le sang fossile ) cette mention d'un champignon saprophyte qui envahit un cadavre EST UNE DECOUVERTE EXCEPTIONELLE !

La putréfaction de dépouilles de vertébrés par des champignons n'a jamais
été examinée dans l'ambre. Cette inclusion est une mention unique.

Ces filaments mycéliens, actinomycètes?, d'un intérêt considérable, ne
pourraient-il pas constituer la base d'un article de science ?

Découverte, Collection et Photographie :
Eric GEIRNAERT, (septembre 2010).

-Dear Eric,The threads look like fungae mycelia. Best regards. Joerg Wunderlich.

-Hi Eric,These look like fungal filaments to me. David Penney.

-I think it is either fungal hyphae or filamentous bacteria, both being common on dead organic material.
These filaments probably started to grow on the vertebrate remain and grew into the liquid resin
for a while before solidification occured. Is this Baltic amber?
With best wishes, Alexander R. Schmidt.

Commentaire de l'inclusion.

Désignés en anglais de Ray fungi, (soit rayonnants champignons) ou "Champignons à rayons" les Actinomycètes sont des bactéries en colonies dont les structures constituées d'hyphes évoluent par croissance centrifuge à partir de la spore d'origine. L'organisme général se matérialise alors par des filaments, très fins, de quelques microns de diamètres. Ces amas filamenteux centrifuges se développent dans la matière organique en décomposition. Ubiquistes et pionnières, ces bactéries filamenteuses peuvent se déployer dans des milieux les plus hostiles, et, la découverte unique de cette mention rare sur une dépouille de vertébré de l'ambre, montre sans conteste que le feutrage existait à l'air libre (sur la dépouille) avant d'être englué et piégé en profondeur dans la résine non indurée.

Et, déjà une seconde découverte dans le même lot de brut !

Autres développements mycéliens d'un très grand
intérêt sur l'épiderme et la dépouille d'un lézard.

Découverte, Collection et Photographie :
Eric GEIRNAERT, (octobre 2010).

D'autres inclusions fossiles seront bientôt présentées dans cette page web.

Vous avez une question, vous souhaitez faire une expertise gratuite de vos inclusions.
Vous pouvez participer au Forum

Pour approfondir l'étude des champignons de l'ambre, voici quelques mentions bibliographiques :

- George O. Poinar, Jr. and Rolf Singer. 1990. Revue Science Vol 248 Juin. Upper Eocene Gilled Mushroom from the Dominican Republic. (p 1099-1101)
- Benjamin M. Waggoner, 1994. Journal of Paleontology. Volume 68, No. 2Mars. pp. 398-401. Fossil Actinomycete in Eocene-Oligocene Dominican Amber
- D. S. Hibbett, D. Grimaldi, M. J. Donoghue. 1995. Revue Nature Vol 377 Octobre. Cretaceous mushrooms in amber. (p 487).
- David S. Hibbett, David Grimaldi and Michael J. Donoghue. 1997. American Journal of Botany 84(8): 981-991. Fossil Mushrooms from miocene and cretaceous ambers and the evolution of HOMOBASIDIOMYCETES.
- Poinar, G.O. 1998. Fossils Explained 22: Palaeontology of amber. Geology Today 14(4): 154-160.
- Hughes, M. et al. 2004. Stigmatomyces from New Zealand and New Caledonia: new records, new species and two new host families. Mycologia 96(4): 834-844.
- Darfelt, H. and Schmidt, A.R. 2005. A fossil Aspergillus from Baltic amber. Mycol. Res. 109(8): 956-960.
- Poinar Jr., G. Poinar, R. 2005. Fossil evidence of insect pathogens. Journal of Invertebrate Pathology 89: 243-250.
- Carmen Ascaso, Jacek Wierzchos, Mariela Speranza, Juan Carlos Gutiérrez , Ana Martín González , Asuncion de los Ríos and Jesús Alonso. 2005. Revue : Micropaleontology, Volume 51, No. 1, pp. 59-72. Fossil Protists and Fungi in Amber and Rock Substrates.
- Rossi, W. et al. 2005. A new species of Stigmatomyces from Baltic amber, the first fossil record of Laboulbeniomycetes. Mycol. Res. 109(3): 271-274.
- Poinar, G.O. and Buckley, R. 2007. Evidence of mycoparasitism and hypermycoparasitism in Early Cretaceous amber. Mycol. Res. 111(4): 503-505.
- Hibbett, D.S. et al. 2007. A higher-level phylogenetic classification of the Fungi. Mycol. Res. 111(5): 509-547.